2009年4月22日星期三

Open reading frame (ORF) vs Coding sequence (CDS)

who can tell me the differents between ORF & CDS?

Open reading frame (ORF) vs Coding sequence (CDS) ?

一点个人看法 1,开放读码框是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列;不是所有读码框都能被表达出蛋白产物,或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白。 2,cds,是编码一段蛋白产物的序列。 3,cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。 4,反之,每个orf不一定都是cds。
 
Open reading frame (ORF) - a reading frame that does not contain a nucleotide triplet which stops translation before formation of a complete polypeptide.

Coding sequence (CDS) - The portion of DNA that codes for transcription of messenger RNA

ORF-----translation, CDS----trancription?  I think the two's explaining are same, but in different sides.

 

开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断。当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什麽。这是因为在没有其它信息的前提下,DNA序列可以按六种框ORF是指一个基因的起始密码子到终止密码子的密码子组合,中间不被终止密码子打断,是直接可以翻译成目的蛋白的核酸序列,也就是成熟mRNA中的cds,是我们做目的基因表达需要连入载体的部分。
架阅读和翻译(每条链三种,对应三种不同的起始密码子)。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或密码子,符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。



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Sincerely yours,
Chuntao Yuan
Shanghai Research Center for Model Organisms
No.3577 Jinke Road,Pudong New District
Shanghai, China 201203

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